Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASQ1P31415 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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CASQ1P31415 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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CASQ1P31415 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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CASQ1P31415 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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CASQ1P31415 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASQ1P31415 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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