Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP1P29466 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP1P29466 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP1P29466 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP1P29466 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP1P29466 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP1P29466 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP1P29466 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP1P29466 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP1P29466 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP1P29466 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP1P29466 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP1P29466 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP1P29466 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP1P29466 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP1P29466 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP1P29466 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP1P29466 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP1P29466 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP1P29466 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP1P29466 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP1P29466 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP1P29466 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP1P29466 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP1P29466 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP1P29466 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP1P29466 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP1P29466 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP1P29466 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP1P29466 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP1P29466 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP1P29466 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP1P29466 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP1P29466 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP1P29466 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP1P29466 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP1P29466 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP1P29466 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP1P29466 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP1P29466 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP1P29466 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP1P29466 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP1P29466 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP1P29466 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP1P29466 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms