Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSFA2P28290 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSFA2P28290 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms