Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POU1F1P28069 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms