Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNTFRP26992 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms