Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPREP23469 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPREP23469 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPREP23469 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPREP23469 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPREP23469 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPREP23469 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPREP23469 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPREP23469 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPREP23469 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPREP23469 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPREP23469 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPREP23469 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPREP23469 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPREP23469 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPREP23469 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPREP23469 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPREP23469 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPREP23469 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPREP23469 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPREP23469 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPREP23469 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPREP23469 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPREP23469 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPREP23469 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPREP23469 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPREP23469 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPREP23469 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPREP23469 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPREP23469 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPREP23469 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPREP23469 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPREP23469 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPREP23469 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPREP23469 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPREP23469 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPREP23469 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPREP23469 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPREP23469 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPREP23469 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPREP23469 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPREP23469 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPREP23469 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPREP23469 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPREP23469 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPREP23469 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPREP23469 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPREP23469 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPREP23469 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPREP23469 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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