Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT1P21579 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT1P21579 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT1P21579 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT1P21579 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT1P21579 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT1P21579 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT1P21579 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT1P21579 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT1P21579 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT1P21579 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT1P21579 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT1P21579 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT1P21579 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT1P21579 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT1P21579 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT1P21579 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT1P21579 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT1P21579 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT1P21579 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT1P21579 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT1P21579 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT1P21579 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT1P21579 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT1P21579 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT1P21579 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT1P21579 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT1P21579 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT1P21579 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT1P21579 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT1P21579 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT1P21579 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT1P21579 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT1P21579 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT1P21579 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT1P21579 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT1P21579 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT1P21579 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT1P21579 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT1P21579 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT1P21579 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms