Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK11BP21127 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK11BP21127 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms