Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms