Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA5P20719 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms