Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT15P19012 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT15P19012 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT15P19012 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT15P19012 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT15P19012 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT15P19012 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT15P19012 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT15P19012 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT15P19012 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRT15P19012 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT15P19012 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT15P19012 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms