Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1A3P13637 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP1A3P13637 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms