Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HKR1P10072 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HKR1P10072 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HKR1P10072 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HKR1P10072 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HKR1P10072 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HKR1P10072 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HKR1P10072 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HKR1P10072 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HKR1P10072 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HKR1P10072 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms