Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGKV1-13P0DP09 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGKV1-13P0DP09 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms