Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00869P0C866 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00869P0C866 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms