Protein–RNA interactions for Protein: P09341

CXCL1, Growth-regulated alpha protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1P09341 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL1P09341 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL1P09341 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms