Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HBE1P02100 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HBE1P02100 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HBE1P02100 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HBE1P02100 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HBE1P02100 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HBE1P02100 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HBE1P02100 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HBE1P02100 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HBE1P02100 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HBE1P02100 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HBE1P02100 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HBE1P02100 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HBE1P02100 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HBE1P02100 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HBE1P02100 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HBE1P02100 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBE1P02100 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HBE1P02100 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HBE1P02100 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBE1P02100 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBE1P02100 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBE1P02100 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBE1P02100 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBE1P02100 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBE1P02100 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBE1P02100 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms