Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRD4O60885 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRD4O60885 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRD4O60885 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD4O60885 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD4O60885 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD4O60885 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD4O60885 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD4O60885 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD4O60885 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD4O60885 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD4O60885 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD4O60885 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD4O60885 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD4O60885 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD4O60885 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD4O60885 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD4O60885 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD4O60885 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD4O60885 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD4O60885 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD4O60885 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD4O60885 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD4O60885 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD4O60885 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD4O60885 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD4O60885 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD4O60885 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD4O60885 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD4O60885 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD4O60885 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD4O60885 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD4O60885 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD4O60885 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD4O60885 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD4O60885 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD4O60885 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD4O60885 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD4O60885 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD4O60885 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD4O60885 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD4O60885 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD4O60885 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD4O60885 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD4O60885 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD4O60885 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD4O60885 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD4O60885 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD4O60885 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD4O60885 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD4O60885 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD4O60885 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD4O60885 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD4O60885 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD4O60885 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD4O60885 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms