Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBAG9O00559 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms