Protein–RNA interactions for Protein: F8W036

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W036 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
F8W036 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F8W036 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F8W036 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F8W036 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F8W036 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F8W036 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8W036 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8W036 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8W036 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8W036 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8W036 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8W036 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8W036 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8W036 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8W036 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8W036 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8W036 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8W036 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8W036 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8W036 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8W036 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8W036 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
F8W036 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
F8W036 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F8W036 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F8W036 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms