Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC160A6NGH7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC160A6NGH7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms