Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2F8A0AVK6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F8A0AVK6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms