Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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