Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms