Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNEQ9Y223 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms