Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms