Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC42EP3Q9UKI2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDC42EP3Q9UKI2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms