Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms