Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms