Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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FAM53CQ9NYF3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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FAM53CQ9NYF3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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FAM53CQ9NYF3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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FAM53CQ9NYF3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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FAM53CQ9NYF3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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FAM53CQ9NYF3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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FAM53CQ9NYF3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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FAM53CQ9NYF3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM53CQ9NYF3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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