Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms