Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC28Q9NX36 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms