Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP2Q9NS61 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms