Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB6BQ9NRW1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms