Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms