Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DUOX1Q9NRD9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms