Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR50

EIF2B3, Translation initiation factor eIF-2B subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF2B3Q9NR50 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EIF2B3Q9NR50 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms