Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM5Q9NQX1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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