Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD4Q9H223 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD4Q9H223 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms