Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms