Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCL11BQ9C0K0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BCL11BQ9C0K0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms