Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC13A1Q9BZW2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC13A1Q9BZW2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms