Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFIH1Q9BYX4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms