Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms