Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC2P3Q9BVR0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC2P3Q9BVR0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms