Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP8Q9BV40 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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VAMP8Q9BV40 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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VAMP8Q9BV40 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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VAMP8Q9BV40 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAMP8Q9BV40 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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