Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3CQ9BUI4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms