Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM43Q9BTV4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms