Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms