Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms